۲۳ روز از حادثه انفجار در بندر شهید رجایی می‌گذرد و با وجود گذشت این زمان، هنوز هیچ نهاد یا سازمانی مسئولیت این فاجعه را بر عهده نگرفته است. با این حال، شواهد و مدارک موجود نشان می‌دهد که سازمان بنادر و دریانوردی در این حادثه مقصر است.
به گفته مهرداد حسن‌زاده، مدیرکل مدیریت بحران استان هرمزگان، انفجار در بندر شهید رجایی ناشی از مواد شیمیایی نگهداری شده در کانتینرهای دپو شده بوده است. این موضوع نشان می‌دهد که سازمان بنادر و دریانوردی که مسئولیت حفظ ایمنی بنادر را بر عهده دارد، در انجام وظایف خود کوتاهی کرده است.
عدم راه‌اندازی بنادر خشک و توسعه آن می‌توانست از انباشت کالا و وقوع حوادثی مانند انفجار جلوگیری کند. با این حال، این موضوع سال‌ها است که در سازمان بنادر و دریانوردی مغفول مانده است.
سعید صادقی، مدیرعامل سابق شرکت تایدواتر خاورمیانه، در این باره گفت: سازمان بنادر و وزارت راه و شهرسازی به عنوان نهاد ناظر باید پاسخگوی این فاجعه انسانی باشند. وی همچنین از تخلفات مدیران قبلی سازمان بنادر و دریانوردی پرده برداری کرد و گفت که محمد سعیدنژاد، رئیس اسبق سازمان بنادر و دریانوردی، در دوران ۸ ساله ریاست خود بر این سازمان، فرصت کافی برای ایجاد اقدامات زیربنایی و توسعه بنادر خشک را داشت، اما به دلیل تعلل و اجرا نشدن طرح‌های زیربنایی، تراکم بار و ریسک‌های مرتبط در بندر شهید رجایی افزایش یافت.
صادقی همچنین از تخلف دیگری در دوران مدیریت سعیدنژاد بر سازمان بنادر و دریانوردی پرده برداری کرد و گفت که در آن زمان، مصوبه‌ای از دولت گرفته شد که براساس آن ۳ هزار هکتار زمین در ضلع غربی بندر شهید رجایی برای احداث پارک لجستیکی و بندرخشک در اختیار سازمان بنادر قرار داده شد، اما در دوران ۸ ساله ریاست سعیدنژاد بر این سازمان، این مصوبه هیات دولت دنبال نشد.
بنادر خشک به عنوان پس‌کرانه‌های بندری و نقاط لجستیکی در عمق خشکی، نقش مهمی در تسهیل تجارت و کاهش فشار بر بنادر اصلی ایفا می‌کنند. با این حال، سازمان بنادر و دریانوردی به دلیل پیگیری نکردن مصوبه هیات وزیران در خصوص ساخت بندر خشک و مشکلات تاخیر و رسوب بیش از حد کالاها باید پاسخگو باشد. همچنین وزیر راه و شهرسازی نیز به دلیل عدم دقت در انتخاب مدیرانی بدون تخصص دانشگاهی و مدرک تحصیلی مرتبط و همچنین نداشتن سابقه کار اجرایی در این حوزه در پست‌های مهم مانند رئیس سازمان بنادر باید پاسخگوی تخلفات صورت گرفته باشد.