در حوزه موتورسیکلت‌ها، ورود این فناوری بسیار محتاطانه‌تر بوده است. فضای محدود، وزن کم، حساسیت بالای تعادل و لرزش، همگی موانعی جدی برای استفاده از غیرفعال‌سازی سیلندر محسوب می‌شوند. با این حال، برخی سازندگان بزرگ مانند هوندا و بی ام و با سرمایه‌گذاری تحقیقاتی گسترده، موفق شده‌اند نمونه‌های عملی و قابل اعتماد این فناوری را ارائه دهند.

برخلاف خودروها، موتورسیکلت‌ها ذاتاً به لرزش و تغییرات گشتاور حساس‌تر هستند. خاموش شدن یک سیلندر می‌تواند تعادل موتور، نرمی حرکت و حتی ایمنی را تحت تأثیر قرار دهد. مهم‌ترین چالش‌های فنی در این حوزه عبارت‌اند از:

در موتورسیکلت‌ها، فاصله موتورسوار تا موتور بسیار کم است و هرگونه لرزش یا تغییر صدای غیرعادی به‌سرعت احساس می‌شود؛ بنابراین سیستم باید انتقال بین حالت فعال و غیرفعال را کاملاً نرم انجام دهد.

افزودن مکانیسم‌های هیدرولیکی یا الکترونیکی برای کنترل سوپاپ‌ها و تزریق سوخت، نباید منجر به افزایش وزن یا پیچیدگی بیش از حد شود.

سیلندر غیرفعال‌ شده ممکن است سردتر از سیلندرهای فعال باقی بماند که این اختلاف دما در بلندمدت می‌تواند به تنش‌های حرارتی منجر شود.